黑龙江省太平沟自然保护区位于黑龙江省萝北县北部，地理坐标为东经130°31′12″－130°50′11″，北纬48°02′48″－48°20′19″。保护区西部和北部以主岗脊为界与鹤北林业局为邻，南与金满屯林场相接，东隔黑龙江与俄罗斯相望。保护区沿黑龙江呈狭长分布，南北长34公里，东西宽15.6公里，总面积为22199公顷，其中，核心区面积为9564公顷，缓冲区面积为6152公顷，实验区面积为6483公顷。保护区内有高等野生植物768种，包括红松、水曲柳等6种国家重点保护野生植物；脊椎动物329种，包括紫貂、原麝等7种国家一级保护野生动物，以及黑熊、棕熊等42种国家二级保护野生动物。该保护区是以保护森林生态系统及其珍稀野生动植物资源为宗旨，是森林生态系统类型的保护区，是集资源保护、科学研究和生态旅游于一体的自然保护区。并在2014年12月，晋升为国家级自然保护区。

 太平沟自然保护区属小兴安岭北坡低山陵地带，地势西高东低，南半部山势较陡，为20°左右，北半部坡度较平缓，坡度在15°以下。全区海拔高72.6－556.7米。保护区位于黑龙江省东北边陲，纬度较高，属北温带大陆性季风气候。区内四季明显，春迟夏短，秋早冬长，风大降水少；夏季短促炎热，秋季降温快，早霜，多风。年平均温为1℃，极端最低温-40℃，极端最高温36.1℃.无霜期111天，日照2580天，年积温2150℃.年降水量为596毫米。区内的土壤主要有四个土类，即暗棕壤、草甸土、沼泽土和泥炭土。区内河流纵横、水源丰富，区内的一、二级支流全部流入黑龙江，主要的一级支流有太平沟河、小渔房沟河、新河口河、一道沟河、二道沟河、三道沟河等。

太平沟自然保护区区内共有高等植物818种，其中苔藓植物135种，蕨类植物40种，种子植物643种，大型真菌253种。其中有国家Ⅱ级重点保护植物6种，红松、钻天柳、野大豆、水曲柳、紫椴、黄檗。

区内有脊椎动物329种，其中鱼类69种，两栖类有7种，爬行类有10种，鸟类186种，哺乳类有47种，此外还有昆虫330种。保护区内共有国家重点保护野生动物40种，其中有国家Ⅰ级重点保护动物4种，有紫貂、原麝、东方白鹳、金雕；国家Ⅱ级重点保护动物36种。

另外区内经济植物很多，资源丰富。本区代表性的草本植物为党参、黄芪、平贝等，并有丰富的藤本植物及果类。同时还拥有丰富的矿产资源，包括煤、黄金等。